У листопаді 1984 року ректором Cтавропольского сільськогосподарського інституту став доктор ветеринарних павук, професор, заслужений діяч науки РРФСР Віктор Якович Нікітін. Закінчивши середню школу в Мордовії, він в 1947 році вступив до Казанського ветеринарного інституту ім. Баумана, після закінчення якого став співробітником однієї з його кафедр. Потім кілька років він працював в Дагестанському сільськогосподарському інституті. У 1961 році Віктор Якович був прийнятий доцентом кафедри акушерства, гінекології та штучного осіменіння в Cтавропольскій сільськогосподарський інститут. Очоливши кафедру, доцент В.Я. Нікітін не обмежився науковою роботою. Вивчаючи мастит овець і методи боротьби з ним, він всіляко пропагував результати своїх досліджень, невтомно впровадив їх у виробництво, читав лекції в господарствах краю про боротьбу з маститами овець яловістю, проводив семінари та бесіди з тваринниками.
З 1985 року в вузі стали навчатися аспіранти з Єгипту, Індії, Алжиру, Іраку, Болгарії, Монголії, Лаосу, Гвінеї, Сирії та Бангладеш. У 1989-90 навчальному році на ветеринарному факультеті навчалися 33 студенти з 12 країн Азії, Африки і Латинської Америки. У наступному навчальному році кількість студентів з-за кордону зросла до 58 осіб з 20 країн.
Впевнений старт в умовах ринкових відносин взяв факультет підвищення кваліфікації. У 1991 році, коли він став функціонувати на принципах господарського розрахунку і фінансування, рівень рентабельності цього підрозділу вузу склав 15 відсотків. З метою розширення традиційної для факультету сфери діяльності по підвищенню кваліфікації в області апробації сільськогосподарських культур, бухгалтерського обліку, застосування електроенергії в сільському господарстві почалася організація короткострокових семінарів по ряду вузьких спеціалізацій.
У 1992 році почалися навчання жителів міст і сіл Ставропілля в школі фермерів. Заняття з бажаючими отримати фермерське освіту стали проводити провідні вчені вузу. У березні того ж року цю школу закінчили 15 слухачів.
Тоді ж в інституті відкрився фермерський факультет, куди на платній основі надійшли 40 осіб з ряду районів краю. Протягом року на лекціях і практичних заняттях вони освоювали різні сільські спеціальності, щоб стати висококваліфікованими фахівцями. Паралельно тривала і підготовка студентів-старшокурсників на місячних курсах фермерів.
Про зміцнення з початком перебудови кадрового складу вчених свідчить той факт, що якщо в 1985 році в вузі працювали 12 докторів наук, то в 1990 - вже вдвічі більше. Причому середній вік професорів знизився за цей період з 66 до 57 років.
Високий рівень навчальної та наукової роботи у вузі був підтверджений висновками Державної атестаційної комісії Державної інспекції з атестації навчальних закладів Росії, яка в листопаді 1993 року підтримала рішення Вченої ради Ставропольського сільськогосподарського інституту про зміну статусу вищого навчального закладу. До цього часу інститут став одним з кращих сільськогосподарських вузів Росії, випередивши більшість їх за основними показниками навчальної та наукової діяльності. 27 квітня 1994 року Державний комітет з вищої освіти прийняв рішення з перетворенні Ставропольського сільськогосподарського інституту в Ставропольську державну сільськогосподарську академію.